Identyfikacja nieuczęszczanych Bacillus z choroby Whipplea ad 8

Wyznaczono 645 pozycji nukleotydów (mniej niż 50 procent genu) i stwierdzono, że bakteria Whipple a jest bakterią Gram-dodatnią o niescharakteryzowanym wysokim poziomie, z wysokim poziomem guaniny i cytozyny, najbardziej zbliżonymi do nocardioformu R. equi. Nasze badanie obejmowało tkanki od 5 niepowiązanych pacjentów z chorobą Whipple a i 10 osób z grupy kontrolnej. Opisana tu 1321-zasadowa sekwencja 16S rRNA była wystarczająca do umieszczenia związanego bacillus w drzewie ewolucyjnym. Drzewo to pokazuje, że Bacillus z chorobą Whipple a dzieli przodka z bakteriami aktynowymi, które są nowsze od tego, które dzieli z nocardioformami. Zaproponowaliśmy również i przetestowaliśmy startery PCR, które mogą być użyte w specyficznym teście diagnostycznym dla Bacillus. Tradycyjne kryteria klasyfikacji organizmów obejmowały fenotypy, które odzwierciedlają biochemiczne, fizjologiczne lub morfologiczne właściwości26. Ocena wielu z tych właściwości zależy od hodowli organizmu in vitro lub in vivo. Analiza sekwencji 16S rRNA nie wymaga hodowli mikrobiologicznej. Chociaż taka analiza może nie dokonać rozróżnienia między blisko spokrewnionymi gatunkami, 27 okazała się wiarygodna w definiowaniu członków tego samego rodzaju. 10 Bacillus choroby Whipple a jest odrębnym organizmem o unikalnych cechach morfologicznych, który przeciwstawił się wysiłkom w uprawie przez 85 lat.2 Nie pojedyncza bakteria została wyizolowana w sposób odtwarzalny od pacjentów z chorobą Whipple a, ani też nie pojawił się żaden specyficzny genotyp lub fenotyp, który mógłby pozwolić na zidentyfikowanie czynnika sprawczego.2 Wierzymy, że nasze dane, wraz z odrębnymi cechami tego organizmu i chorobą, z którą mamy do czynienia. jest związany, dostarcza ostatecznych informacji filogenetycznych na temat tej bakterii i podstawę do specyficznego wykrywania. Każda z bakterii najbliżej spokrewnionych z Bacillus należy do odrębnego rodzaju, jednak ewolucyjna odległość między Bacillus i dowolną z tych bakterii jest nie mniejsza niż między dowolnymi dwoma w obrębie tej grupy. Z tych powodów proponujemy rodzaj i nazwę gatunku dla Bacillus: Tropheryma whippelii gen. nov. sp. nov. (od greckiego tropu, pożywienia i erymu, bariery, ponieważ powoduje ona złe wchłanianie i od nazwiska George Whipple).
Czy relacje filogenetyczne T. whippelii pokazane na rycinie 3 są zgodne z tym, co było wiadomo o tym organizmie. Promieniowce są zróżnicowaną grupą bakterii, których klasyfikacja suprageneryczna jest poddawana rewizji.22 Większość z nich to tlenowe organizmy glebowe, które tworzą rozgałęzione filamenty lub strzępki. Struktura ściany T. whippelii nie przypomina dokładnie żadnej z wcześniej zbadanych bakterii; jednak, podobnie jak wiele promieniowców, jest to gram-dodatnie i pozytywne dla PAS. Wszystkie z wyjątkiem jednego z organizmów pozytywnych wobec PAS w jednym badaniu stanowiły promienice28. Chociaż T. whippelii nie wydaje się tworzyć rozgałęzione filamenty lub strzępki w tkance ludzkiej, korzystne warunki do rozwoju tego organizmu są nieznane. Cechy morfologiczne promieniowców mogą się różnić w zależności od warunków wzrostu. 29, 30 Znajomość związków filogenetycznych T. whippelii może prowadzić do określenia warunków hodowli tego organizmu in vitro
[przypisy: olx hrubieszów, zabiegi fizykalne, dyżury aptek polkowice ]